ยูโครมาตินเป็นส่วนของโครโมโซมที่มีการขดตัวรวมกับโปรตีนในระยะอินเตอร์เฟส และคลายตัวเมื่อเกิดการลอกแบบและแบ่งเซลล ์รวมทั้งมีการแสดงออกของยีนได้ตามปกติ DNA ที่เป็นยูโครมาตินจะกระจายอยู่ทั่วไปบนโครโมโซม ยกเว้นบริเวณเซนโทรเมียร์ เวลาย้อมสีโครโมโซมจะเห็นยูโครมาตินติดสีจาง
เฮทเทอโรโครมาติน เป็นส่วนของโครโมโซมที่มี DNA ขดตัวแน่น พบมากบริเวณใกล้เซนโทรเมียร์ ซึ่งเป็นบริเวณที่ไม่มีการแสดงออกของยีน เมื่อย้อมสีโครโมโซมจะเห็นเฮทเทอโรโครมมาตินติดสีเข้ม
ภาพที่ 1 แสดงส่วนของโครโมโซมที่เป็นยูโครมาตินและเฮทเทอโรโครมาติน